Chimie

Analyse de structure et cristallographie des protéines

Analyse de structure et cristallographie des protéines



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Vous avez travaillé dans l'unité d'analyse structurale et de cristallographie des protéines et recherchez du matériel supplémentaire ? Ensuite, nous vous recommandons les unités d'apprentissage suivantes :

Modélisation moléculaire dans la conception de médicaments75 minutes

PharmacieChimie pharmaceutiqueConception de médicaments

La modélisation moléculaire comprend diverses méthodes et techniques, principalement informatiques, pour la dérivation, la représentation et la manipulation de structures chimiques tridimensionnelles et des propriétés moléculaires physico-chimiques qui en découlent, ainsi que pour la modélisation de réactions chimiques. Étant donné que la plupart des molécules sont des systèmes flexibles qui peuvent prendre des états différents et énergétiquement équivalents, la modélisation de molécules individuelles n'est en aucun cas triviale et nécessite une puissance de calcul considérable. La modélisation et la simulation des processus de liaison est d'autant plus complexe qu'il faut tenir compte des particularités de la cible ainsi que des ligands étudiés ainsi que du milieu ou solvant dans lequel se déroule la réaction. Pour cette raison, les modèles calculés représentent un compromis entre les paramètres les plus réalistes possibles et les simplifications ou approximations nécessaires aux conditions réelles.Par exemple, pour simplifier les calculs d'énergie, les molécules sont visualisées de manière analogue à des corps macroscopiques avec une certaine surface et un certain volume et des réactions sont généralement dans les soi-disant « conditions idéales » (par exemple dans le vide) sont calculés.

Conception de médicaments basée sur la structure60 minutes

PharmacieChimie pharmaceutiqueConception de médicaments

Contrairement à l'approche combinatoire de la conception de médicaments, qui repose sur le criblage d'un grand nombre de composés synthétisés au hasard, la conception basée sur la structure, comme son nom l'indique, repose sur la connaissance de la structure de la cible et/ou d'autres déjà connus. Ingrédients actifs. Dans le premier cas, le tramage est au premier plan, dans le second cas, le dessin. L'approche basée sur la structure est donc également appelée conception rationnelle ou ciblée de médicaments. Elle repose sur l'hypothèse fondamentale que l'effet d'une substance résulte de sa liaison plus ou moins intensive à la molécule cible. On suppose également que les deux molécules dans cette conformation, dite active ou liée, se comportent de manière géométriquement et chimiquement complémentaires l'une de l'autre et provoquent ainsi la bioactivité. Dans la plupart des cas, une substance n'obtient un effet biologique que si elle s'insère dans la poche de liaison spécifique d'une cible et s'ancre (par exemple dans le centre actif d'une enzyme) et empêche ainsi l'accès au ligand naturel.


Vidéo: Solide cristallin et maille cristalline. Enseignement scientifique 1ère physique chimie (Août 2022).